Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga4Q00651 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga4Q00651 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms