Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NOMO3P69849 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOMO3P69849 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms