Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab11aP62492 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab11aP62492 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms