Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vbp1P61759 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vbp1P61759 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms