Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cldn18P56857 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn18P56857 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms