Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CckbrP56481 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CckbrP56481 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CckbrP56481 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CckbrP56481 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms