Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab2aP53994 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab2aP53994 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms