Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtbP53612 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RabggtbP53612 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtbP53612 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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