Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srp9P49962 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srp9P49962 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp9P49962 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms