Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPFP49454 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPFP49454 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPFP49454 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPFP49454 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPFP49454 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPFP49454 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPFP49454 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPFP49454 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPFP49454 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CENPFP49454 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CENPFP49454 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CENPFP49454 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CENPFP49454 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CENPFP49454 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms