Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALDH1A3P47895 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ALDH1A3P47895 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms