Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syt1P46096 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt1P46096 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt1P46096 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms