Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XCR1P46094 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XCR1P46094 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XCR1P46094 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
XCR1P46094 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
XCR1P46094 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
XCR1P46094 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
XCR1P46094 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
XCR1P46094 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
XCR1P46094 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
XCR1P46094 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
XCR1P46094 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms