Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tbxas1P36423 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tbxas1P36423 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tbxas1P36423 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms