Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd28P31041 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd28P31041 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd28P31041 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms