Protein–RNA interactions for Protein: P28825

Mep1a, Meprin A subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mep1aP28825 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mep1aP28825 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mep1aP28825 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms