Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gjb3P28231 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gjb3P28231 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms