Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5F1P24539 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms