Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NfyaP23708 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NfyaP23708 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms