Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPS6KB1P23443 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KB1P23443 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KB1P23443 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms