Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMPD1P23109 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMPD1P23109 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms