Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gna11P21278 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gna11P21278 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms