Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18530 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18530 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18530 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18530 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18530 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18530 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18530 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18530 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P18530 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms