Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG2P13521 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG2P13521 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG2P13521 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG2P13521 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCG2P13521 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCG2P13521 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCG2P13521 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms