Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calb1P12658 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Calb1P12658 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Calb1P12658 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms