Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fv4P11370 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fv4P11370 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fv4P11370 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms