Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl2P10148 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms