Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CT47B1P0C2W7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CT47B1P0C2W7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms