Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax1P09084 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pax1P09084 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms