Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc4a1P04919 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc4a1P04919 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a1P04919 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms