Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNNC2P02585 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNNC2P02585 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms