Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MscO88940 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MscO88940 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MscO88940 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MscO88940 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MscO88940 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MscO88940 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MscO88940 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MscO88940 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MscO88940 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MscO88940 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms