Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm10509O88255 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm10509O88255 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm10509O88255 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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