Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TULP3O75386 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TULP3O75386 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TULP3O75386 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TULP3O75386 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TULP3O75386 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TULP3O75386 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TULP3O75386 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TULP3O75386 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TULP3O75386 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TULP3O75386 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms