Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Xirp1O70373 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Xirp1O70373 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms