Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap2O55126 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms