Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr2O55101 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms