Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stag2O35638 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stag2O35638 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stag2O35638 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stag2O35638 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Stag2O35638 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Stag2O35638 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms