Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC27A2O14975 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC27A2O14975 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A2O14975 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC27A2O14975 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms