Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BHLHE40O14503 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms