Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21900J3QP38 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21900J3QP38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21900J3QP38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21900J3QP38 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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