Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34c2J3QNM1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34c2J3QNM1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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