Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mcmdc2E9Q956 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mcmdc2E9Q956 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mcmdc2E9Q956 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms