Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ttc17E9PVB5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttc17E9PVB5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.9 ms