Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm5934D3Z4U6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5934D3Z4U6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms