Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms