Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmf1B9EKI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmf1B9EKI3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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