Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trappc11B2RXC1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trappc11B2RXC1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms