Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cyp26c1B2RXA7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cyp26c1B2RXA7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms