Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp36B1AQJ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp36B1AQJ2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Usp36B1AQJ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Usp36B1AQJ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms